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正文:
〈1〉生活史的觀察
以
解剖顯微鏡觀察生活史中的各個(gè)階段,如:聚集、偽原生質(zhì)體,孢子囊體等。
〈2〉 孢子與孢子囊柄細(xì)胞的觀察
利用滅菌后的解剖針挑起一株孢子囊體于載玻片上,加一滴水蓋上蓋玻片,以光
學(xué)顯微鏡觀察,使用顯微
測(cè)量尺測(cè)孢子大小、極粒的有無(wú)和孢子囊柄頂端形態(tài)及基部寬度與相關(guān)圖鑑做對(duì)照,以辨別其種類
※每一形態(tài)特征取約20個(gè)測(cè)量,均逢機(jī)選取,再求出大小范圍、平均值及標(biāo)準(zhǔn)差
抽取DNA
1. 取一tube(微量離心管)并加入50μl ddH2O(經(jīng)過(guò)二次滅菌過(guò)的純水)
2. 探針尖端以酒精高熱消毒,從培養(yǎng)皿挑入50~100個(gè)細(xì)胞黏菌的孢子囊堆(sorus)
3. 加入sea sand(海砂)適量,以研磨棒研磨數(shù)次
4. 加入500μl預(yù)熱65℃之2﹪CTAB buffer (1.4 M NaCl, 100 mM Tris-HCl, pH 8.0, 20 mM EDTA, 2% PVP-40【w/v】, 20 mM cetyl trimethyl ammonium bromide【CTAB】;and 0.5% 2-mercaptoethanol【v/v】),略研磨以混合之
5. 加入3μl 2-mercaptoethand(hood),置于65℃水浴槽水浴十分鐘以破壞細(xì)胞壁
6. 加入500μl dichlormethane : isoamyl alcohol(24:1)(hood),以紙巾覆蓋震盪
7. 室溫下離心13000rpm 7mins,抽取上清液于新tube
8. 加入300μl isopropanol(hood),以紙巾覆蓋震盪,室溫下離心13000rpm 7mins以沉淀DNA
9. 去除上清液,加入500μl wash buffer(76% ethanol, 10 mM ammonium acatate)去除鹽類物質(zhì)靜置二分鐘
10. 室溫下離心13000rpm 7mins,去除上清液并倒置烘乾
11.加入30μl ddH2O,放在37℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)30分鐘
※完成后最好直接進(jìn)行聚合酶連鎖反應(yīng),否則需要冷藏保存
(一)聚合酶連鎖反應(yīng) (Polymerase chain reaction,PCR)轉(zhuǎn)錄ITS1區(qū)域步驟
1. 取一新tube依序加入下表溶液(單位μl):
2. 各取45μl加入每個(gè)抽好DNA的tube(不能有氣泡)
3. 置于聚合酶反應(yīng)器進(jìn)行40循環(huán) ※保存需冷凍
(二)PCR產(chǎn)物檢測(cè)(電泳)
1. 取一塊用ethidium bromide染色的2﹪洋菜膠連同膠盤置入電泳槽,注入1x TBE buffer直到液面略淹過(guò)洋菜膠
2. 取一張乾淨(jìng)的parafilm,滴2μl DNA loading dye及2μl DNA marker混合后滴入洋菜膠第一格樣品槽作為標(biāo)記,藉不同大小的DNA分子相異的位移鑑定產(chǎn)物大小
3. 混合 2μl DNA loading dye及5μl PCR產(chǎn)物分別滴入樣品槽
4. 進(jìn)行電泳約25分鐘,取出膠片置于紫外線透視觀察箱下拍照紀(jì)錄
(三)DNA定序
將所得的PCR產(chǎn)物采用自動(dòng)定序分析儀(ABI PRISM 3100 Genetic Analyzer、ABI 3730 DNA Analyzer , USA),以定序套組(ABI PRISM BigDyeTM Cycle Sequencing Ready Reaction Kit)進(jìn)行PCR反應(yīng),來(lái)進(jìn)行菌株的定序
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北京顯微鏡百科
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